Depuis 1983, les galeries abritent des objets hétéroclites, à mi chemin entre l’histoire, l’archéologie et la culture populaire du Japon. Des habitations de samouraïs reconstituées y côtoient un jardin botanique et un parc, peuplé de cerisiers.
Par ailleurs, ce musée a la particularité d’occuper la double fonction d’institut de recherche, résolument tourné vers l’avenir. En tant que membre d’un programme pluri-universitaire, Rekihaku délivre cours et diplômes sur les trois thématiques qui composent les collections du musée, les plus complètes au monde.